磁共振灌注科研软件

磁共振灌注科研软件

详细介绍


    NordicICE是全世界最先进的磁共振灌注数据处理软件,由Nordicneurolab公司与挪威奥斯陆大 atle bjornerud教授共同开发,目前已经在全世界接近400个医院和科研单位使用,发表高水平SCI文章400余篇,其中不乏Nature Medcine,Lancet,Neurology,Radiology等顶级期刊。

    NordicICE将磁共振灌注临床科研推动了一个崭新的高度,软件非常便捷,功能强大,可以在几秒钟生成高质量的 DCEDSCASL 灌注图。点击几个按键就可以对灌注数据进行批处理。

       NordicICE 包含灌注和渗透性灌注分析软件包,在这些模块下,利用先进的方法,可以定量性地和半定量性地解释与组织灌注和毛细血管渗透性相关的生理参数。这些先进功能,操作便捷的界面,大量的工具,优异的算法,迅速的处理速度使得NordicICE成为灌注临床科研的极佳工具。

 

    Dynamic Contrast Enhanced Perfusion (DCE)动态对比增强灌注

   --高级的动力学建模

  --针对 AIF(动脉输入函数)的部分体积校正,当前层的 AIF,当前 ROI(感兴趣脑
      区) 或基于
AIF 的被试

  --生成大量的参数图


 

    Dynamic Susceptibility Contrast Perfusion (DSC) 动态敏感性对比灌注
    --全脑检测、当前层、当前感兴趣区或基于被试的
AIF 去卷积分析
    --高级的渗漏校正
    --大量的高级分析条目选择

    --生成大量的参数图



    Arterial Spin Labeling (ASL) 动脉自旋标记
   --简易的拖、 放界面
   --综合的头动校正和
Mo->ASL 融合

   --定量分析



    弛豫时间RelaxometryT1 T2 图)

   --多种数据类型的 T1 分析:反转恢复、饱和度恢复或多重翻转角
   --高级数据建模选项


    Diffusion Weighted Imaging (DWI)弥散加权成像

   --神经,腹部,前列腺,胸部,骨骼
   --
双指数的分析



    多数据批处理Batch functionality for processing of many dataset

    --数据的转换、下采样、重采样
    --
ROI 分析
    --从数据中简易提取图像体素输出到
excel 而进行进一步分析

    --灌注分析,DCE 分析,T1 的弛豫分析

    


 

    Pixel Editor体素编辑

  --半自动分割

   --手动编辑功能

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    模块和功能

    --DSC 灌注和 DCE 渗透

    --动脉自旋标记

    --弛豫时间( T1 T2 图)

    --弥散加权成像

    --弥散张量成像(DTI)

    --血氧水平依赖脑功能成像(BOLD)

    --批处理

    --DICOM 数据集

    --广泛的一般图像分析工具


NordicICE 4.0 功能列表:

 

介绍

nordicICE 4.0是一款集可视化、分析、处理为一体的专注科研的软件包。可用于DICOMnifti格式图像的评估。nordicICEperfusionDCEASLDWIDTIBOLD fMRI等图像均能进行有效的分析处理。

 

主要功能包括:

 

Perfusion灌注分析可以根据造影剂的首过效应获取定量或者半定量的灌注图。灌注模块包括

         分析T1T2像的首过效应

         根据去卷积技术修正动脉输入函数(AIF)

         手动或自动探测AIF,或者选用默认AIF

         校正造影剂渗漏技术

 

DCE动态增强(DCE)分析根据造影剂动态效应可以自动或者半自动的获取与血管通透性有关的量化参数图。DCE模块包括

         测量wash-inwash-out、曲线下面积(AUC)、峰值时间(TTP)等动态曲线参数

         多参数的示踪动力学模型估计KtransKepVeVp等参数

         手动或自动检测AIF,并进行优化校正。同时进行部分容积校正

 

ASL支持伪连续ASL以及脉冲ASL,通过血流自身作为内源性示踪剂,绘制血流图。

 

T1T2弛豫(T1T2)能分析组织弛豫特性。T1弛豫可以基于多种数据(序列):翻转恢复,饱和反转或者多重翻转角数据。两个模块均包含高阶分析方法,同时输出多幅参数图。

 

DWI弥散加权分析用于刻画局部水扩散的自由度,可以用作单或双指数模型分析,同时提供扩展选项,多参数图输出。

 

BOLDfMRIBOLD分析用于刻画人脑中由神经元活动引起的局部血流变化。

 

DTI/纤维束追踪:弥散张量分析用于可视化局部水的扩散特性,以此描述不同组织的水分子的各向异性扩散自由度。纤维束追踪用来显示大脑白质的结构走向

 

批处理功能:能处理多个数据集。通过一次设置,可以同时对多个数据集进行自动处理,不需要人工干预。这个模块包括分析perfusionDCETI弛豫、ASL、图像格式转换、配准、预处理以及多种图像分析工具。

 

特点列表:

         基于模块的后处理,perfusionDCEASLBOLD fMRIDWIDTI及弛豫分析

         友好的用户界面,逐步的分析

         有效的批处理模块

         DICOM数据库使得分析、存储数据更加方便

         支持DICOMNIFTI数据格式

 

图像装载及保存

         兼容多个MR生产商设备的图像数据

         可以读多种图像格式

                  DicomNIFTIRAWBMPJPEGTIFF

                  可以渲染多种DICOM格式数据,包括无损JPEG压缩格式、RGB格式、马赛克以及帧格式

         ※通过多种类型接口装载图像,具体类型依据图像格式及用户偏好

         方便将图像转换到其他windows应用

         提供DICOM头文件的修改操作,例如患者信息匿名化等

         数据的查询、检索、输入、输出及发送功能

         将图像存储为不同类型,如:DICOMNIFTIjpgbmprawavi

         图像转换,DICOMNIFTINIFTIDICOM

        

Perfusion模块

         使用预设的参数,通过ctrl+p按键实现快速perfusion分析

         快速生成输出结果图,包括

                  相对血流量(rBF)

                  相对血容量(rBV)

                  平均通过时间(MTT)

                  峰值时间(TTP)/延迟

                  渗漏图(Ktrans)

                  卡方图

         额外附加的输出图,用于高阶分析和质量控制

         相对或半定量分析

         最新的去卷积技术

                  标准的奇异值去卷积(SVD)

                  非敏感延迟SVD

         对分割的灰质和白质进行自动标准化

         手动或自动选择AIF,或者默认选择AIF

         检测AIF的像素或ROI的动态曲线

         渗漏校正

         血管分割

         对输入函数或者组织曲线进行gamma变量的自适应

         运动校正

         perfusion及结构像的简单融合

 

 

DCE模块

         最新的去卷积技术校正AIF

         快速生成定性及定量的结果图,包括

                  Ktrans

                  Kep

                  Ve

                  Vp

                  AUC

                  峰值时间

                  峰值增强

                  wash-in/wash-out速率

         手动或自动选择AIF,或者默认AIF

         检查AIF像素或者ROI的动态曲线,校正部分容积效应

         运动校正

         所选择的处理选项

         perfusion及结构像的简单融合

 

DWI模块

         针对DWI图像的一个或者三个方向上的扩散分析

         任意选取b

         单或者双指数曲线拟合,同时对数据点进行非均匀加权

         预处理

                  空间平滑

                  时间平滑

                  自动计算噪声截止频率

         表观扩散系数(ADC)曲线拟合,同时如果b值接近噪声水平,可提供高阶参数模型

         去除突变图像

         简化的IVIM模型

         输出结果图包括

                  ADCADC(fast)ADC(slow)

                  体积分数(fast andslow)

                  bMaxT2校正的bMax

                  各向异性:基于三个扩散梯度方向的伪各项异性

                  卡方

 

ASL

         产生perfusion(CBF)

         支持伪连续ASL及脉冲ASL

         简单的图像融合接口

         运动校正及M0ASL的配准

         定性及定量分析

                  运用M0图像或者ASL的控制图像进行定量分析

         ASL输出数据中生成时间序列

         检测突变图像,设置平滑及噪声水平阈值

         自动检测图像层数采集顺序,如果需要可以手动修改

 

批处理

         对多个数据集进行批处理

         指定输入数据的文件夹及输出结果的文件夹

         DICOMNIFTI的格式均可使用

         批处理中的分析包括

                  PerfusionDCEASLT1的分析

                  图像转换、下采样、重采样

                  预处理、运动校正、配准

                  标准化、制作掩模、ROI分析、像素抽取

 

T1弛豫分析

         T1弛豫可分析多种输入数据类型:反转恢复、饱和恢复或者多翻转角数据

         突变图像的移除、时间和空间的平滑以及噪声水平探测等高阶选项

         非均匀最小二乘加权进行曲线分析

         产生T1结果图、R1图、M0图以及卡方图

 

T2弛豫分析

         T2T2*弛豫分析

         基线校正、突变图像移除、时间和空间平滑以及噪声探测

         非均匀最小二乘加权进行曲线分析

         产生T2/T2*结果图、R2/R2*图、M0图以及卡方图

 

DTI模块

         DTI预处理包括

                  运动校正

                  涡流校正

                  噪声阈值自动探测

                  平滑图像

         运动及涡流校正图像伪影

         DTI图像和结构像进行配准

         扩散梯度配置简便快捷

                  自动从DICOM头文件提取扩散梯度配置

                  自定义配置文件

         快速产生参数图

                  伪彩DTI

                  部分各向异性图(FA)

                  表观扩散系数/平均扩散系数(ADC)

                  跟踪加权

                  张量特征值(λ1λ2、λ3)

         运用种子点/目标方法或者枚举法进行3D纤维束跟踪成像(FACT算法)

         通过调整终止条件(FA值、纤维束转角及最小纤维长度)最优化跟踪结果

         3D的白质纤维束叠加到不同的图像上(如:结构像、FA像、伪彩特征值图等)

         使用ROI工具交互式选择特殊区域的白质纤维束

         将纤维束叠加到3D BOLD fMRI激活图上

         可保存参数图、3D快照或者动画成多种格式或者直接到PACS

 

BOLDfMRI模块

         导入、建立或者编辑BOLD设计文件,包括:

                  BOLD范式和对比矩阵

                  预处理步骤

         fMRI预处理包括

                  时间层校正

                  运动校正

                  高斯平滑

                  高通滤波

         基于一般线性模型(GLM)BOLD分析

         激活图叠加到结构像,并进行2D/3D可视化

         结合BOLD激活图和白质纤维束图,并进行3D可视化

         交互式设置统计图阈值

         自动配准结构和功能像数据集

         将统计图、3D快照和动画保存为多种文件格式,或直接传输到PACS

 

快速设置

BOLD/DTI设置向导可以简单快捷的设置BOLDDTI分析步骤(选择病人-选择序列-编辑设置-分析-可视化结果)

 

图像可视化

         ※显示各种医学图像

         ※检索、显示3D4D数据集

         ※多种显示格式

         ※循环显示

         ※显示图像DICOM头文件的相关信息

         ※在多平面重建窗口(MPR)中显示MR图像

         3D可视化BOLD激活图和DTI纤维束

         ※在MPR中调整图像显示方向

 

图像处理

         ※灵活直接的图像处理工具

                  图像放大、缩小等操作

                  平滑

                  修改窗宽窗位

                  修改颜色面板

 

图像分析

         ※定性或定量分析图像的特定属性

                  ROI分析:

                          多种ROI类型

                          简单、可重复修改的ROI分析

                          ROI中的数据转换到windows其他应用中(如:Excel)

                          动态ROI分析(时间-灰度曲线等)

                                   与算法相关的动态ROI数据曲线拟合:质子弛豫分析

                                   对比剂动力学模型

                                   其他高阶MR分析模型

                          ROI直方图分析

         VOI分析

         ※灰度线轮廓分析

         ※像素分割分析

         ※制作图像掩模

         ※分割及像素编辑

 

图像处理

         ※使用定义的处理算法对图像进行处理

         ※多平面重建显示(MPR)

         ※图像数学操作(相减、相加等)

         ※动态图像分析工具包

         ※图像叠加

                  在一个数据集上叠加多个图像

                  每个叠加图像都可以单独调整设置(颜色板、透明度等)

                  兼容分SPM/分析图像格式

         ※配准

                  基于DICOM几何信息将叠加图像进行配准

                  手动调整叠加图像的位置

         ※重采样配准后的nifti数据


时间:2018/3/19 10:45:23  【打印此页】 【关闭】 【返回
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